Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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