Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chchd5Q9CQP3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chchd5Q9CQP3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd5Q9CQP3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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