Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms