Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms