Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska1Q9CPV1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska1Q9CPV1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms