Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbc3Q99ML1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms