Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms