Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim7Q923T7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim7Q923T7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms