Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms