Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BbxQ8VBW5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BbxQ8VBW5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms