Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc47a1Q8K0H1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc47a1Q8K0H1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms