Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssuh2Q8C3L1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssuh2Q8C3L1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms