Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim35Q8C006 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms