Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsfm13Q8BXS2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms