Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Suds3Q8BR65 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Suds3Q8BR65 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Suds3Q8BR65 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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