Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms