Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms