Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms