Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms