Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms