Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam222bQ6P539 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms