Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Ggnbp1Q6K1E7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms