Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp7Q6A4J8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp7Q6A4J8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms