Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna3Q65CL1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms