Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a1Q60737 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a1Q60737 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms