Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd5Q5VCS6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms