Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkaa1Q5EG47 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms