Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed1Q3V009 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms