Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc190Q3URK1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms