Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms