Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mccc2Q3ULD5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms