Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Yipf3Q3UDR8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms