Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem104Q3TB48 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem104Q3TB48 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem104Q3TB48 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem104Q3TB48 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem104Q3TB48 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem104Q3TB48 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem104Q3TB48 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms