Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
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