Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms