Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms