Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rcn1Q05186 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcn1Q05186 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms