Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms