Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dlx4P70436 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dlx4P70436 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms