Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Crabp1P62965 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms