Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rab1AP62821 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab1AP62821 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rab1AP62821 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab1AP62821 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms