Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hpcal1P62748 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hpcal1P62748 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms