Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strn4P58404 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strn4P58404 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms