Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gp1bbP56400 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms