Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax7P47239 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax7P47239 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms