Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf1P46099 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klf1P46099 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms