Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NodalP43021 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NodalP43021 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NodalP43021 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NodalP43021 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NodalP43021 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NodalP43021 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NodalP43021 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NodalP43021 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NodalP43021 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NodalP43021 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NodalP43021 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NodalP43021 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NodalP43021 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms