Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab20P35295 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab20P35295 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms