Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms