Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms